Identificado e registrado em 1967 por pesquisadores, o Sítio Arqueológico Sambaqui da Tarioba só voltou a ser redescoberto em 1997, quando uma lâmina de machado foi encontrada no quintal da Casa da Cultura durante uma reforma.
A denominação do sítio escolhida pela equipe tem origem Tupi-Guarani. A palavra SAMBAQUI significa “monte de conchas”. Já a palavra TARIOBA veio em respeito à própria população local que assim conhecia a anomalocardia, espécie de concha encontrada no sambaqui.
As demarcações e prospecções do local tiveram início também em 1997, sob a coordenação de técnicos do IAB-Instituto de Arqueologia Brasileira. Em 1998, começou a fase das escavações seguida pela avaliação e análise de todo o material arqueológico encontrado desde restos esqueletais, material lítico (material de pedra), artefatos, adornos e material malacológico (conchas).
Em 1999, todo esse processo culminou no I Encontro de Arqueologia da Costa Fluminense em Rio das Ostras, quando também foi inaugurado o Museu de Sítio Arqueológico Sambaqui da Tarioba.

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